O procedimento abaixo pode ser usado para migrar o banco ou até para fazer um backup:
Fazer a copia do banco de dados:
mysqldump -u root -p zabbix > /tmp/zabbix_db_dump
Transferir para outro servidor:
Scp /tmp/zabbix_db_dump Username@IP Address:/tmp
Restaurar para novo banco:
Create database zabbix;z
mysql -u root -p zabbix < /tmp/zabbix_db_dump